ПРОТЕОМНОЕ ПРОФИЛИРОВАНИЕ ШТАММОВ ESCHERICHIA COLI, ИЗОЛИРОВАННЫХ ОТ ПАЦИЕНТОВ С БОЛЕЗНЬЮ КРОНА

DOI: 
10.29296/24999490-2018-01-04

Д.С. Матюшкина (1), О.В. Побегуц (1), кандидат биологических наук, О.Н. Букато (1),
Д.В. Ракитина (1), кандидат биологических наук, Ю.П. Байкова (1), кандидат биологических наук,
В.Г. Ладыгина (1), кандидат биологических наук, Д.Н. Андреев (2), И.В. Маев (2), доктор медицинских наук, профессор, член-корреспондент РАН, П.Л. Щербаков (3), доктор медицинских наук,
профессор, В.М. Говорун (1), доктор биологических наук, профессор, академик РАН
1-Федеральный научно-клинический Центр физико-химической медицины ФМБА России,
Российская Федерация, 119435, Москва, ул. Малая Пироговская, д. 1а;
2-Государственный медико-стоматологический университет им. А.И. Евдокимова Минздрава России, Российская Федерация, 127473, Москва, ул. Делегатская улица, д. 20 стр. 1;
3-Московский клинический научно-практический центр Департамента здравоохранения г. Москвы, Российская Федерация, 111123, Москва, шоссе Энтузиастов, д. 86
E-mail: dna-mit8@mail.ru

Введение. Один из возможных механизмов патогенеза болезни Крона (БК) – провокация неконтролируемого иммунного ответа условно-патогенными микроорганизмами, колонизующими слизистую оболочку кишечника. В роли такого микроорганизма рассматривают Escherichia coli, поскольку в ряде исследований микробиоты кишечника больных БК у части пациентов обнаружено его повышенное содержание. Неясно, однако, являются БК-ассоциированные E. coli комменсальными штаммами или патогенными. Цель. Выявить отличия E. coli, изолированных от больных БК и от здоровых. Сравнить белковые профили клинических изолятов E. coli при культивировании в лабораторных условиях. Материал и методы. Сравнение проводились методом дифференциального 2Д-электрофореза с последующим MALDI-масс-спекрометрическим анализом. Результаты и обсуждение. В клетках E. coli от больных БК было повышено содержание белков триптофаназы (tnaA), глутаматдекарбоксилазы (gadB), малатдегидрогеназы (mdh) и транспортеров-хеморецепторов рибозы (rbsB) и галактозы (mglB). Триптофаназа производит сигнальную молекулу – индол. В микробиоте индол способен индуцировать устойчивость к антибиотикам, фагоцитозу, образование биопленки, вирулентность и продукцию токсина. С другой стороны, данная сигнальная молекула вызывает в кишечнике человека усиление барьерной функции эпителия и регулирует экспрессию провоспалительных генов. Рецепторы хемотаксиса к рибозе и галактозе отражают предпочтение этих источников углерода патогенными E. coli при колонизации кишечника. Глутаматдекарбоксилаза обеспечивает кислотоустойчивость бактерий при прохождении через желудок, обеспечивая эффективность перорального заражения. Экспрессия генов mdh и rbsB повышена при образовании биопленок у патогенных E. coli. Мембранный белок порин А имеет различную pI у изолятов от больных БК и здоровых людей. Предполагается его участие в патогенезе в процессах адгезии и инвазии, выживании внутри макрофагов, избегании иммунного ответа. Заключение. Обнаружены отличия изолятов от больных БК, характерные для патогенных E. coli, что позволяет предположить их активную роль в патогенезе.
Ключевые слова: 
Болезнь Крона, Escherichia coli, триптофаназа, патоген