Исследование ассоциации с внезапной сердечной смертью однонуклеотидных полиморфизмов rs34643859 гена KCNS1, rs12804550 гена SCN4b, RS4514993 гена SCN11a

DOI: https://doi.org/10.29296/24999490-2021-05-05

А.А. Иванова(1), Е.С. Мельникова(1), А.А. Гуражева(1), С.К. Малютина(1, 2), И.А. Родина(3), О.В. Хамович(3), В.П. Новоселов(2, 3), В.Н. Максимов(1, 2) 1-Научно-исследовательский институт терапии и профилактической медицины – филиал ФГБНУ «Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук», Российская Федерация, 630089, Новосибирск, ул. Б. Богаткова, д. 175/1; 2-ФГБОУ ВО «Новосибирский государственный медицинский университет» Министерства здравоохранения Российской Федерации, Российская Федерация, 630091, Новосибирск, Красный проспект, д. 52; 3-ГБУ здравоохранения Новосибирской области «Новосибирское областное клиническое бюро судебно-медицинской экспертизы», Российская Федерация, 630087, Новосибирск, ул. Немировича-Данченко, д. 134 E-mail: ivanova_a_a@mail.ru

Введение. Однонуклеотидные полиморфизмы rs34643859 гена KCNS1, rs12804550 гена SCN4B, rs4514993 гена SCN11A выявлены в ходе анализа результатов собственного полноэкзомного секвенирования группы молодых мужчин, умерших внезапной сердечной смертью (ВСС) как возможные новые молекулярно-генетические маркеры ВСС. Целью исследования является верификация однонуклеотидных полиморфизмов rs34643859, rs12804550, rs4514993 в качестве маркеров ВСС в исследовании «случай-контроль» с использованием рутинных методов молекулярно-генетического анализа. Цель исследования. Проверить ассоциацию с ВСС однонуклеотидных полиморфизмов rs34643859, rs12804550, rs4514993. Методы. Группа ВСС (n=400, средний возраст умерших – 53,2±8,7 года, доля мужчин – 70,9%, женщин – 29,1%) сформирована c использованием критериев ВСС Европейского общества кардиологов из анонимного банка ДНК лиц умерших внезапной смертью (1999–2019 гг.). Контрольная группа (n =400, средний возраст – 53,1±8,3 года, мужчины – 68,3 %, женщины – 31,7%) подобрана по полу и возрасту к группе ВСС из банков ДНК живых на момент проведения исследований участников международных проектов MONICA и HAPIEE. Генотипирование проведено с использованием метода полимеразной цепной реакции с последующим анализом полиморфизма длин рестрикционных фрагментов. Результаты. Не выявлено статистически значимых различий по частотам генотипов и аллелей однонуклеотидных полиморфизмов rs12804550, rs4514993 между группой ВСС и контрольной группой (p>0,05). В группе женщин в возрасте до 50 лет выявлено статистически значимое уменьшение носительниц генотипа ТТ rs34643859 в группе ВСС (32,3%) по сравнению с контрольной группой (60,0%) (TT vs TC + CC: ОШ=0,32, 95% ДИ 0,11–0,91, р=0,04). Заключение. Не подтверждена ассоциация однонуклеотидных полиморфизмов rs12804550 гена SCN4B, rs4514993 гена SCN11A с ВСС. Однонуклеотидный полиморфизм rs34643859 гена KCNS1 ассоциирован с ВСС: у женщин до 50 лет, генотип ТТ связан с протективным эффектом в отношении ВСС.
Ключевые слова: 
внезапная сердечная смерть, однонуклеотидный полиморфизм

Список литературы: 
  1. Шляхто Е.В., Арутюнов Г.П., Беленков Ю.Н. Национальные Рекомендации по определению риска и профилактике внезапной сердечной смерти. Aрхив внутренней медицины. 2013; 4: 5–15. [Shljahto E.V., Arutjunov G.P., Belenkov Ju.N., Ardashev A.V. Recommendations for risk assessment and prevention of sudden cardiac death. Archive of internal medicine. 2013; 4: 5–15 (in Russian)]
  2. Priori S.G., Blomström-Lundqvist C., Mazzanti A., Blom N., Borggrefe M., Camm J., Elliott P.M., Fitzsimons D., Hatala R., Hindricks G., Kirchhof P., Kjeldsen K., Kuck K.H., Hernandez-Madrid A., Nikolaou N., Norekvål T.M., Spaulding C., Van Veldhuisen D.J. The Task Force for the Management of Patients with Ventricular Arrhythmias and the Prevention of Sudden Cardiac Death of the European Society of Cardiology (ESC). G Ital Cardiol. 2016; 17 (2):108–70.
  3. dbSNP [Internet]. Bethesda (MD): National Library of Medicine (US), National Center for Biotechnology Information. rs34643859; [released 2020 Apr 21; cited 2020 Oct 18]; Available from: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/snp/rs34643859
  4. Hendry L., Lombard Z., Wadley A., Kamerman P. KCNS1, but not GCH1, is associated with pain intensity in a black southern African population with HIV-associated sensory neuropathy: a genetic association study. J. Acquir Immune Defic Syndr. 2013; 63 (1): 27–30. DOI: 10.1097/QAI.0b013e318285cf36.
  5. dbSNP [Internet]. Bethesda (MD): National Library of Medicine (US), National Center for Biotechnology Information. rs12804550; [released 2020 Apr 21; cited 2020 Oct 18]; Available from: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/snp/rs12804550
  6. Yang Q., Xiong H., Xu C., Huang Y., Tu X., Wu G., Fu F., Wang Z., Wang L., Zhao Y., Li S., Huang Y., Wang C., Wang D., Yao Y., Wang F., Wang Y., Xue Y., Wang P., Chen Q., Pu J., Wang Q.K. Identification of rare variants in cardiac sodium channel β4-subunit gene SCN4B associated with ventricular tachycardia. Mol Genet Genomics. 2019; 294 (4): 1059–71. DOI: 10.1007/s00438-019-01567-7.
  7. 7. Li R.G., Wang Q., Xu Y.J., Zhang M., Qu X.K., Liu X., Fang W.Y., Yang Y.Q. Mutations of the SCN4B-encoded sodium channel β4 subunit in familial atrial fibrillation. Int J. Mol. Med. 2013; 32 (1): 144–50. DOI: 10.3892/ijmm.2013.1355.
  8. dbSNP [Internet]. Bethesda (MD): National Library of Medicine (US), National Center for Biotechnology Information. rs4514993; [released 2020 Apr 21; cited 2020 Oct 18]; Available from: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/snp/rs4514993
  9. Ginanneschi F., Rubegni A., Moro F., Volpi N., Santorelli F.M., Rossi A. SCN11A variant as possible pain generator in sensory axonal neuropathy. Neurol Sci. 2019; 40 (6): 1295–7. DOI: 10.1007/s10072-019-3703-4.
  10. Coll M., Allegue C., Partemi S., Mates J., Del Olmo B., Campuzano O., Pascali V., Iglesias A., Striano P., Oliva A., Brugada R. Genetic investigation of sudden unexpected death in epilepsy cohort by panel target resequencing. Int J. Legal Med. 2016; 130 (2): 331–9. DOI: 10.1007/s00414-015-1269-0.