ПРОТОКОЛ ОЦЕНКИ ГИСТОЛОГИЧЕСКОГО МИКРОПРЕПАРАТА ДЛЯ ПРОВЕДЕНИЯ МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИХ ИССЛЕДОВАНИЙ

DOI: https://doi.org/10.29296/24999490-2021-02-01

А.М. Борбат(1), И.В. Яценко(2) 1-Медико-биологический университет инноваций и непрерывного образования ФГБУ ГНЦ ФМБЦ им. А.И. Бурназяна ФМБА России, Российская Федерация, 123098, Москва, ул. Живописная, д. 46; 2-Биомедицинский холдинг «Атлас», Российская Федерация, 121069, Москва, ул. Малая Никитская, д. 31 E-mail: [email protected]

В статье проведен обзор литературы о тенденциях применения молекулярно-генетических методов исследований опухолевой ткани с использованием рутинного гистологического материала в клинической практике. В работе предложен формализованный протокол оценки гистологического материала опухолевой ткани для последующих генетических исследований. Протокол включает паспортную часть, описательную часть, которая содержит характеристики репрезентативности опухолевой ткани в материале, выраженность некротических изменения, фоновую ткань и морфологические признаки отклонений на преаналитических этапах, заключение о пригодности материала и графическую схему для упрощения измерения площади гистологического среза на предметном стекле. Протокол составлен на двух языках: русском и английском, поскольку большое количество генетических исследований проводится за рубежом и отсутствие необходимости перевода должно облегчить коммуникацию между специалистами в различных странах. Электронная версия протокола и шкала для оценки площади опухолевой ткани на предметном стекле предлагаются для использования патологоанатомами и специалистами в области лабораторной медицинской генетики и доступны для скачивания в формате pdf. Применение данного протокола может способствовать стандартизации процедуры оценки опухолевого материала и упрощению коммуникации между лабораторными службами и, как следствие, повышению качества медицинской помощи.
Для цитирования: 
Борбат А.М., Яценко И.В. ПРОТОКОЛ ОЦЕНКИ ГИСТОЛОГИЧЕСКОГО МИКРОПРЕПАРАТА ДЛЯ ПРОВЕДЕНИЯ МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИХ ИССЛЕДОВАНИЙ. Молекулярная медицина, 2021; (2): -https://doi.org/10.29296/24999490-2021-02-01
Список литературы: 
  1. Cho M., Ahn S., Hong M., Bang H., Van Vrancken M., Kim S., Lee J., Park S.H., Park J.O., Park Y.O., Lim H.Y., Kang W., Sun J.M., Lee S.H., Ahn M.J., Park K., Kim D.H., Lee S., Park W., and Kim K.M. Tissue recommendations for precision cancer therapy using next generation sequencing: a comprehensive single cancer center’s experiences. Oncotarget. 2017; 8 (26): 42478–86. DOI: 10.18632/oncotarget.17199.
  2. Kokkat T.J., Patel M.S., McGarvey D., LiVolsi V.A., and Baloch Z.W. Archived Formalin-Fixed Paraffin-Embedded (FFPE) Blocks: A Valuable Underexploited Resource for Extraction of DNA, RNA, and Protein. Biopreserv Biobank. 2013; 11 (2): 101–6. DOI: 10.1089/bio.2012.0052.
  3. Chung M.J., Lin W., Dong L., and Li X. Tissue Requirements and DNA Quality Control for Clinical Targeted Next-Generation Sequencing of Formalin-Fixed, Paraffin-Embedded Samples: A Mini-Review of Practical Issues. J. Mol. Genet Med. 2017; 11: 2. DOI: 10.4172/1747-0862.1000262.
  4. FoundationOne CDx Specimen Instructions. URL: https://www.foundationmedicine.com/genomic-testing/foundation-one-cdx (дата обращения: 22.06.2020)
  5. Specimen Preparation Instructions Caris Molecular Intelligence URL https://www.carismolecularintelligence.com/wp-content/uploads/2017/12/TN0252-v8_Specimen_Prep_Instructions_hi-rez.pdf (дата обращения: 22.06.2020)
  6. Lindeman N.I., Cagle P.T., Aisner D.L., Arcila M.E., Beth Beasley M., Bernicker E.H., Colasacco C., Dacic S., Hirsch F.R., Kerr K., Kwiatkowski D.J., Ladanyi M., Nowak J.A., Sholl L., Temple-Smolkin R., Solomon B., Souter L.H., Thunnissen E., Tsao M.S., Ventura C.B., Wynes N.W., and Yatabe Y. Updated Molecular Testing Guideline for the Selection of Lung Cancer Patients for Treatment With Targeted Tyrosine Kinase Inhibitors. Arch Pathol Lab Med. 2018; 142: 321–46. DOI: 10.5858/arpa.2017-0388-CP.
  7. Ответы на вопросы об особенностях работы с FFPE образцами тканей. Beckman Coulter Life Sciences. URL: https://www.mybeckman.ru/resources/technologies/next-generation-sequencing/challenges-with-ffpe-tissue-samples (дата обращения: 22.06.2020).
  8. Solutions for Cancer Genomics. URL: https://www.agilent.com/en/solutions/genomics/ngs-for-pathology (дата обращения: 22.06.2020)
  9. Ivanov M., Laktionov K., Breder V., Chernenko P., Novikova E., Telysheva E., Musienko S., Baranova A., Mileyko V. Towards standardization of next-generation sequencing of FFPE samples for clinical oncology: intrinsic obstacles and possible solutions. J. Transl Med. 2017; 15 (1): 22. DOI: 10.1186/s12967-017-1125-8.
  10. Smits A.J., Kummer J.A., Bruin P.C., Bol M., van den Tweel J.G., Seldenrijk K.A., Willems S.M., Offerhaus G.J.A., de Weger R.A., van Diest P.J., Vink A. The estimation of tumor cell percentage for molecular testing by pathologists is not accurate. Modern Pathology. 2014; 27: 168–74. DOI: 10.1038/modpathol.2013.134.
  11. Loree L.M., Kopetz S., Raghav K.P.S. Current companion diagnostics in advanced colorectal cancer; getting a bigger and better piece of the pie. J. Gastrointest Oncol. 2017; 8 (1): 199–212. DOI: 10.21037/jgo.2017.01.01.
  12. Dufraing K., van Krieken J.H., De Hertogh G., Hoefler G., Oniscu A., Kuhlmann T.P., Weichert W., Marchiò C., Ristimäki A., Ryška A., Scoazec J.Y., and Dequeker E. Neoplastic cell percentage estimation in tissue samples for molecular oncology: recommendations from a modified Delphi study. Histopathology. 2019; 75 (3): 312–9. DOI: 10.1111/his.13891.
  13. Park S., Holmes-Tisch A.J., Yoon Cho E., Mog Shim Y., Kim J., Song Kim H., Lee J., Hee Park Y., Seok Ahn J., Park K., Jänne P.A., Ahn M-Ju. Discordance of Molecular Biomarkers Associated with Epidermal Growth Factor Receptor Pathway between Primary Tumors and Lymph Node Metastasis in Non-small Cell Lung Cancer. J. Thorac Oncol. 2009; 4: 809–15. DOI: 10.1097/JTO.0b013e3181a94af4.
  14. Thunnissen E., Kerr K.M., Herth F.J.F., Lantuejoul S., Papotti M., Rintoul R.C., Rossi G., Skov B.G., Weynand B., Bubendorf L., Katrien G., Johansson L., López-Rios F., Ninane V., Olszewski W., Popper H., Jaume S., Schnabel P., Thiberville L., Laenger F. The challenge of NSCLC diagnosis and predictive analysis on small samples. Practical approach of a working group. Lung Cancer. 2012; 76 (1): 1–18. DOI: 10.1016/j.lungcan.2011.10.017.
  15. Lhermitte B., Egele C., Weingertner N., Ambrosetti D., Dadone B., Kubiniek V., Burel-Vandenbos F., Coyne J., Michiels J.F., Chenard M.P., Rouleau E., Sabourin J.C., Bellocq J.P. Adequately Defining Tumor Cell Proportion in Tissue Samples for Molecular Testing Improves Interobserver Reproducibility of Its Assessment. Virchows Arch. 2017; 470 (1): 21–7. DOI: 10.1007/s00428-016-2042-6.
  16. Dufraing K., Hertogh G., Tack V., Keppens C., Dequeker E.M.C., Hanvan Krieken J. External Quality Assessment Identifies Training Needs to Determine the Neoplastic Cell Content for Biomarker Testing. The Journal of Molecular Diagnostics. 2018; 20 (4): 455–64. DOI: 10.1016/j.jmoldx.2018.03.003.
  17. Brown R.W., Della Speranza V., O Alvarez J., Eisen R.N., Frishberg D.P., Rosai J., Santiago J., Tunnicliffe J., Colasacco C., Lacchetti C., Thomas N.E. Uniform Labeling of Blocks and Slides in Surgical Pathology. Arch Pathol Lab Med. 2015; 139: 1515–24. DOI: 10.5858/arpa.2014-0340-SA.