АНАЛИЗ АЛЛЕЛЬНОГО ПОЛИМОРФИЗМА ГЕНА ACTA2 У ПАЦИЕНТОВ С НЕСЕМЕЙНОЙ АНЕВРИЗМОЙ ВОСХОДЯЩЕГО ОТДЕЛА АОРТЫ С ПОМОЩЬЮ ПИРОСЕКВЕНИРОВАНИЯ

DOI: https://doi.org/None

В.А. Жуков (1,2), кандидат биологических наук, А.И. Жернаков (1,2), Н.Д. Гаврилюк (1), А.Г. Пинаев (2), Е.Е. Андронов (2), кандидат биологических наук, В.Е. Успенский (1), кандидат медицинских наук, О.Б. Иртюга (1), кандидат медицинских наук, О.М. Моисеева (1), доктор медицинских наук 1 -Федеральный медицинский исследовательский центр им. В.А. Алмазова Минздрава России, Российская Федерация, 197341, Санкт-Петербург, ул. Аккуратова, д. 2; 2 -Всероссийский научно-исследовательский институт сельскохозяйственной микробиологии, Российская Федерация, 196608, Санкт-Петербург, г. Пушкин, ш. Подбельского, д. 3 E-mail: moiseeva.cardio@gmail.com

Введение. Ген ACTA2 кодирует α-актин в гладкомышечных клетках аорты, и мутации в нем могут быть причиной развития аневризм восходящего отдела аорты. Анализ полиморфизма гена ACTA2 может быть использован в качестве фактора комплексной оценки риска развития несемейной аневризмы аорты. Цель исследования. Изучить вклад аллельного полиморфизма гена ACTA2 в развитие несемейных случаев аневризмы восходящего отдела аорты. Методы. Кодирующие белок экзоны гена ACTA2 (со 2-го по 9-й) с прилегающими участками интронов были амплифицированы на смесях проб ДНК 83 пациентов с несемейной аневризмой аорты и 34 обследованных контрольной группы и секвенированы на приборе GS Junior (Roche). Результаты. В обеих группах были обнаружены SNP (сайты однонуклеотидного полиморфизма), лежащие в области интронов, но в пределах экзонов полиморфизма не найдено. Заключение. У обследованных 83 пациентов с несемейной аневризмой восходящего отдела аорты нуклеотидный полиморфизм в кодирующей части гена ACTA2 отсутствовал. Дальнейшие исследования на расширенной выборке пациентов позволят оценить целесообразность секвенирования гена ACTA2 в случае несемейной аневризмы аорты.
Ключевые слова: 
секвенирование нового поколения (NGS), ген ACTA2, аневризмы аорты, полиморфизм генов

Список литературы: 
  1. Hoyert D.L., Heron M.P., Murphy S.L., Kung H.-C. Deaths: final data for 2003. National vital statistics reports. 2006; 54 (13): 1–120.
  2. Chau K.H., Elefteriades J.A. Natural history of thoracic aortic aneurysms: size matters, plus moving beyond size. Progress in Cardiovascular Diseases. 2013; 56 (1): 74–80.
  3. Hagan P.G., Nienaber C.A., Isselbacher E.M., Bruckman D., Karavite D.J., Russman P.L., Evangelista A., Fattori R., Suzuki T., Oh J.K. The International Registry of Acute Aortic Dissection (IRAD): new insights into an old disease. Jama. 2000; 283 (7): 897–903.
  4. Ehrlich M.P., Ergin M.A., Mccullough J.N., Lansman S.L., Galla J.D., Bodian C.A., Apaydin A., Griepp R.B. Results of immediate surgical treatment of all acute type A dissections. Circulation. 2000; 102 (3): 248–52.
  5. Hiratzka L.F., Bakris G.L., Beckman J.A., Bersin R.M., Carr V.F., Casey D.E., Eagle K.A., Hermann L.K., Isselbacher E.M., Kazerooni E.A. 2010 ACCF/AHA/AATS/ACR/ASA/SCA/SCAI/SIR/STS/SVM guidelines for the diagnosis and management of patients with thoracic aortic disease. J. of the American College of Cardiology. 2010; 55 (14): 27–129.
  6. Pomianowski P., Elefteriades J.A. The genetics and genomics of thoracic aortic disease. Annals of Cardiothoracic Surgery. 2013; 2 (3): 271–9.
  7. Guo D.-C., Pannu H., Tran-Fadulu V., Papke C.L., Yu R.K., Avidan N., Bourgeois S., Estrera A.L., Safi H.J., Sparks E. Mutations in smooth muscle α-actin (ACTA2) lead to thoracic aortic aneurysms and dissections. Nature genetics. 2007; 39 (12): 1488–93.
  8. Bergeron S.E., Wedemeyer E.W., Lee R., Wen K.-K., Mckane M., Pierick A.R., Berger A.P., Rubenstein P.A., Bartlett H.L. Allele-specific effects of thoracic aortic aneurysm and dissection α-smooth muscle actin mutations on actin function. Journal of Biological Chemistry. 2011; 286 (13): 11356–69.
  9. Глотов А.С., Вашукова Е.С., Данилова М.М., Пакин В.С., Машарский А.Э., Федотов П.В., Зайнулина М.С., Аржанова О.Н., Мозговая Е.В., Баранов В.С. Секвенирование нового поколения (NGS) для изучения гена ACVR2A у беременных с гестозом. Молекулярная медицина. 2014; 5: 33–40.[Glotov A.S., Vashukova E.S., Danilova M.M., Masharsky A.E., Fedotov P.V., Zaynulina M.S., Arzhanova O.N., Mozgovaya E.V., Baranov V.S. Application of NGS method for ACVR2A gene sequencing in women with preeclampsia. Molekulyarnaya Meditsina. 2014; 5: 33–40]
  10. Faita F., Vecoli C., Foffa I., Andreassi M.G. Next generation sequencing in cardiovascular diseases. World Journal of Cardiology. 2012; 4 (10): 288–95.
  11. Sikkema-Raddatz B., Johansson L.F., Boer E.N., Almomani R., Boven L.G., Berg M.P., Spaendonck-Zwarts K.Y., Tintelen J.P., Sijmons R.H., Jongbloed J.D. Targeted Next-Generation Sequencing can replace Sanger sequencing in clinical diagnostics. Human Mutation. 2013; 34 (7): 1035–42.
  12. Droege M., Hill B. The Genome Sequencer FLX™ System–Longer reads, more applications, straight forward bioinformatics and more complete data sets. J. of Biotechnology. 2008; 136 (1): 3–10.
  13. Roder C., Peters V., Kasuya H., Nishizawa T., Wakita S., Berg D., Schulte C., Khan N., Tatagiba M., Krischek B. Analysis of ACTA2 in European Moyamoya disease patients. European J. of Paediatric Neurology. 2011; 15 (2): 117–22.
  14. Langmead B., Salzberg S.L. Fast gapped-read alignment with Bowtie 2. Nature methods. 2012; 9 (4): 357–9.
  15. Li H., Handsaker B., Wysoker A., Fennell T., Ruan J., Homer N., Marth G., Abecasis G., Durbin R. The sequence alignment/map format and SAMtools. Bioinformatics. 2009; 25 (16): 2078–9.
  16. Guo D.-C., Papke C.L., Tran-Fadulu V., Regalado E.S., Avidan N., Johnson R.J., Kim D.H., Pannu H., Willing M.C., Sparks E. Mutations in smooth muscle alpha-actin (ACTA2) cause coronary artery disease, stroke, and moyamoya disease, along with thoracic aortic disease. The American J. of Human Genetics. 2009; 84 (5): 617–27.
  17. Renard M., Callewaert B., Baetens M., Campens L., Macdermot K., Fryns J.-P., Bonduelle M., Dietz H.C., Gaspar I.M., Cavaco D. Novel MYH11 and ACTA2 mutations reveal a role for enhanced TGFβ signaling in FTAAD. International J. of Cardiology. 2013; 165 (2): 314–21.