НОВЫЕ МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИЕ МАРКЕРЫ ВНЕЗАПНОЙ СЕРДЕЧНОЙ СМЕРТИ, ВЫЯВЛЕННЫЕ МЕТОДОМ СЕКВЕНИРОВАНИЯ СЛЕДУЮЩЕГО ПОКОЛЕНИЯ (NGS)

DOI: https://doi.org/10.29296/24999490-2018-05-05

А.А. Иванова(1), кандидат медицинских наук, В.Н. Максимов(1, 2), доктор медицинских наук, доцент, С.К. Малютина(1, 2), доктор медицинских наук, профессор, К.Н. Колесник1, А.В. Алешкина(1), С.В. Савченко(2, 3), доктор медицинских наук, профессор, В.П. Новоселов(2, 3), доктор медицинских наук, профессор, М.И. Воевода(1), доктор медицинских наук, профессор 1-«Научно-исследовательский институт терапии и профилактической медицины» – филиал ФГБНУ «Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук», Российская Федерация, 630089, Новосибирск, ул. Б. Богаткова, д. 175/1; 2-Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования «Новосибирский государственный медицинский университет» Минздрава России, Российская Федерация, 630091, Новосибирск, Красный проспект, д. 52; 3-Государственное бюджетное учреждение здравоохранения Новосибирской области «Новосибирское областное клиническое бюро судебно-медицинской экспертизы», Российская Федерация, 630087, Новосибирск, ул. Немировича-Данченко, д. 134 Е-mail: ivanova_a_a@mail.ru

Целью исследования явились поиск и изучение ассоциации мутаций A1744S гена MYH7, 9928_9929insE гена TTN, T171M гена CACNA1C, A189T гена JPH2, S434Y гена VCL, H4552R гена RYR2, Y1495X гена SCN5A с внезапной сердечной смертью (ВСС). Исследуемые мутации были обнаружены как связанные с ВСС по результатам зарубежных исследований, проведенных методами секвенирования следующего поколения. Материал и методы. Группа ВСС сформирована с использованием критериев ВСС Европейского общества кардиологов (n=391; средний возраст – 53,2±8,7 года; мужчины – 72,7%, женщины – 27,3%), контрольную группу подбирали с учетом пола и возраста из банка ДНК международных исследований HAPIEE, MONICA (n=400; средний возраст 53,1±8,3 года; мужчины – 68,3%, женщины – 31,7%). ДНК выделена методом фенолхлороформной экстракции из ткани миокарда в группе ВСС и венозной крови в контрольной группе. Генотипирование проведено методом полимеразной цепной реакции с последующим анализом полиморфизма длин рестрикционных фрагментов. Подтверждающее секвенирование выполнено методом капиллярного электрофореза на аппарате Hitachi 3500 Genetic Analyzer (Applied Biosystems, США). Результаты. В группах ВСС и контрольной не выявлено носителей редких аллелей мутаций A1744S гена MYH7, T171M гена CACNA1C, A189T гена JPH2, S434Y гена VCL, H4552R гена RYR2, Y1495X гена SCN5A. Гетерозиготные носители мутации 9928_9929insE гена TTN найдены в группе ВСС (4,1%) и контрольной (3,8%). По частоте генотипов мутации 9928_9929insE гена TTN не выявлено статистически значимых различий между группами, в том числе и при разделении групп по полу и возрасту. Выводы. Мутации A1744S гена MYH7, 9928_9929insE гена TTN, T171M гена CACNA1C, A189T гена JPH2, S434Y гена VCL, H4552R гена RYR2, Y1495X гена SCN5A не связаны с ВСС в исследованной выборке лиц умерших вследствие ВСС.
Ключевые слова: 
внезапная сердечная смерть, мутация

Список литературы: 
  1. Шляхто Е.В., Арутюнов Г.П., Беленков Ю.Н., Ардашев А.В. Национальные Рекомендации по определению риска и профилактике внезапной сердечной смерти. Архивъ внутренней медицины. 2013; 4: 5–15. [Shljahto E.V., Arutjunov G.P., Belenkov Ju.N., Ardashev A.V. Recommendations for risk assessment and prevention of sudden cardiac death Archive of internal medicine. 2013; 4: 5–15 (in Russian)]
  2. Priori S.G., Blomström-Lundqvist C., Mazzanti A., Blom N., Borggrefe M., Camm J., Elliott P.M., Fitzsimons D., Hatala R., Hindricks G., Kirchhof P., Kjeldsen K., Kuck K.H., Hernandez-Madrid A., Nikolaou N., Norekvål T.M., Spaulding C., Van Veldhuisen D.J. The Task Force for the Management of Patients with Ventricular Arrhythmias and the Prevention of Sudden Cardiac Death of the European Society of Cardiology (ESC). G Ital Cardiol. 2016; 17 (2): 108–70.
  3. Narula N., Tester D.J., Paulmichl A., Maleszewski J.J., Ackerman M.J. Post-mortem Whole exome sequencing with gene-specific analysis for autopsy-negative sudden unexplained death in the young: a case series. Pediatr Cardiol. 2015; 36 (4): 768–78.
  4. Tan Z.P., Xie L., Deng Y., Chen J.L., Zhang W.Z., Wang J., Yang J.F., Yang Y.F. Whole-exome sequencing identifies Y1495X of SCN5A to be associated with familial conduction disease and sudden death. Sci Rep. 2014; 4: 5616.
  5. Sambrook J., Russell D.W. Purification of nucleic acids by extraction with phenol:chloroform. CSH Protoc. 2006; 1.
  6. TTN titin [Homo sapiens (human)]. Database Gene. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/7273.
  7. Hinson J.T., Chopra A., Nafissi N. et al. Titin mutations in iPS cells define sarcomere insufficiency as a cause of dilated cardiomyopathy. Science. 2015; 349 (6251): 982–6.
  8. Pernigo S., Fukuzawa A., Pandini A., Holt M., Kleinjung J., Gautel M., Steiner R.A. The crystal structure of the human titin:obscurin complex reveals a conserved yet specific muscle M-band zipper module. J. Mol. Biol. 2015; 427 (4): 718–36.
  9. Carmignac V., Salih M.A., Quijano-Roy S., Marchand S., Rayess M.M., Mukhtar M.M., Urtizberea J.A., Labeit S., Guicheney P., Leturcq F., Gautel M., Fardeau M., Campbell K.P., Richard I., Estournet B., Ferreiro A. C-terminal titin deletions cause a novel early-onset myopathy with fatal cardiomyopathy. Ann. Neurol. 2007; 61 (4): 340–51.
  10. Baydar Ç.L., Özen M. A hypertrophic and dilated cardiomyopathic sudden cardiac death case; de novo mutations in TTN and SGCD genes. Anatol J. Cardiol. 2016; 16 (11): 887–8.
  11. rs368327166. Database dbSNP. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/SNP/snp_ref.cgi?rs=368327166.
  12. Larsen M.K., Nissen P.H., Berge K.E., Leren T.P., Kristensen I.B., Jensen H.K., Banner J. Molecular autopsy in young sudden cardiac death victims with suspected cardiomyopathy. Forensic Sci Int. 2012; 219 (1–3): 33–8.
  13. Cann F., Corbett M., O’Sullivan D., Tennant S., Hailey H., Grieve J.H., Broadhurst P., Rankin R., Dean J.C. Phenotype-driven molecular autopsy for sudden cardiac death. Clin. Genet. 2017; 91 (1): 22–9.
  14. CACNA1C calcium voltage-gated channel subunit alpha1 C [Homo sapiens (human)] Database Gene. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/775.
  15. Beavers D.L., Wang W., Ather S., Voigt N., Garbino A., Dixit S.S., Landstrom A.P., Li N., Wang Q., Olivotto I., Dobrev D., Ackerman M.J., Wehrens X.H. Mutation E169K in junctophilin-2 causes atrial fibrillation due to impaired RYR2 stabilization. J. Am. Coll. Cardiol. 2013; 62 (21): 2010–9.
  16. rs730880254. Database dbSNP. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/SNP/snp_ref.cgi?rs=730880254.
  17. rs757541730. Database dbSNP. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/SNP/snp_ref.cgi?rs=757541730.
  18. Cheng J., Kyle J.W., Wiedmeyer B., Lang D., Vaidyanathan R., Makielski J.C. Vinculin variant M94I identified in sudden unexplained nocturnal death syndrome decreases cardiac sodium current. Sci Rep. 2017; 7: 42953.
  19. rs768299786. Database dbSNP. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/SNP/snp_ref.cgi?rs=768299786.
  20. Hertz C.L., Christiansen S.L., Ferrero-Miliani L., Fordyce S.L., Dahl M., Holst A.G., Ottesen G.L., Frank-Hansen R., Bundgaard H., Morling N. Next-generation sequencing of 34 genes in sudden unexplained death victims in forensics and in patients with channelopathic cardiac diseases. Int J. Legal Med. 2015; 129 (4): 793–800.
  21. Magnani J.W., Brody J.A., Prins B.P., Arking D.E., Lin H., Yin X., Liu C.T., Morrison A.C., Zhang F., Spector T.D., Alonso A., Bis J.C., Heckbert S.R., Lumley T., Sitlani C.M., Cupples L.A., Lubitz S.A., Soliman E.Z., Pulit S.L., Newton-Cheh C., O’Donnell C.J., Ellinor P.T., Benjamin E.J., Muzny D.M., Gibbs R.A., Santibanez J., Taylor H.A., Rotter J.I., Lange L.A., Psaty B.M., Jackson R.Z, Rich S.S., Boerwinkle E., Jamshidi Y., Sotoodehnia N. Sequencing of SCN5A identifies rare and common variants associated with cardiac conduction: Cohorts for Heart and Aging Research in Genomic Epidemiology (CHARGE) Consortium. Circ Cardiovasc Genet. 2014; 7 (3): 365–73.